PSIE-PD FBE UII berdiri pada 6 Juli 2000, saat ini menawarkan dua konsentrasi bidang studi: Konsentrasi Ilmu Ekonomi, dan Konsentrasi Akuntansi.
Konsentrasi Ilmu Ekonomi memiliki 2 kekhususan: Ekonomi Islam dan Kebijakan Publik.
Konsentrasi Akuntansi memiliki 4 kekhususan: Akuntansi Keuangan, Sistem Informasi, Akuntansi Sektor Publik, dan Auditing.
Pada tahun penyelenggaraan ke 17, Desember 2017, PSIE-PD mendapatkan akreditasi A berdasarkan SK BAN PT No. 5209/SK/BAN-PT/Akred/D/XII/2017.
Sampai dengan September 2022 PSIE-PD telah meluluskan 113 doktor yang mayoritas merupakan dosen di berbagai perguruan tinggi negeri maupun swasta di Indonesia.
PSIE-PD FBE UII saat ini merupakan salah satu mitra lembaga pemberi beasiswa LPDP dan BPI, sehingga setiap calon mahasiswanya yang berlatar belakang dosen yang memiliki NIDN berhak mengajukan beasiswa pendidikan doktor dari kedua lembaga tersebut.
Sebagian besar lulusan sudah memiliki publikasi ilmiah di jurnal internasional bereputasi dan karya lainnya pada saat diwisuda, sehingga sangat mendukung dalam pengembangan karir mereka di tempat pengabdian masing-masing.